栽培种的接种栽培种是直接用于生产的菌种，其培养基的配方与母种基本相同，所用容器也与母种相同。栽培种的接种是把母种转接到培养基上进行扩大培养，选用优质母种，按无菌操作程序进行。接种时先将母种的瓶口移向酒精灯火焰上，去掉盖子或棉塞，转动瓶口，使瓶口的周围都得到火焰灭菌，再用镊子去除母种表面的菌膜，然后用镊子或接种匙取母种块到栽培种的培养基上，盖上瓶盖，贴好标签，于22～24℃在培养室培养。一般一瓶母种可接栽培种40～70瓶(图3．19)。
银耳的母种只使用菌种的上层部分，越往瓶下部银耳菌丝越少(主要是香灰菌菌丝)，接种后影响出耳率。所以在使用银耳母种时，要先把耳芽去掉，然后将上面1／3的菌种搅拌混匀，取混匀的菌种接入栽培种培养基表面即可。用于生产的银耳栽培种使用时同样只取菌种的上层部分。
(3)菌种污染的原因
菌种生产中，防止杂菌污染是母种和栽培种成败的关键。造成杂菌污染的原因有以下几种：
①在栽培种的接种块上及周围出现杂菌，而培养基的其他部位未发现任何杂菌，这可能是母种已被杂菌污染。所以要严格检查母种的质量。
②瓶(袋)内培养基上、中、下不同的地方均出现杂菌，是由于培养基灭菌不彻底造成的。需要改善灭菌条件，改进灭菌方法。
③培养基表面出现杂菌，其他地方没有污染。这可能是接种室(箱)消毒、灭菌不彻底，操作工具、手等消毒不严或棉塞太松，使得杂菌孢子从瓶口落入而造成的。
④棉塞上出现霉菌，然后蔓延到培养基内，这往往是由于棉塞过于潮湿引起的。
⑤菌种在培养后期，有时在培养基的表面出现杂菌，是由于培养室的环境不清洁，空气中杂菌的孢子量过多，菌种瓶的瓶盖或棉塞包扎不紧，杂菌孢子从缝隙侵入，造成培养后期的污染。
(4)菌种质量检验的目测指标
检测菌种是为了判定所得的菌种是否为优良菌株；鉴定所分离得到的菌种或引进的菌种是否为所需要的菌种。否则误用被污染了或老化的菌种或用错了菌种，都会对生产造成很大损失。菌种检验的指标很多，这里介绍一下它的目测指标。以耳类菌种为例：
木耳原种菌丝白色，后略呈米黄色，似细羊毛状，平贴培养基匍匐生长，菌丝短，前端整齐，生长速度为0．5厘米／天，13～15天长满斜面。菌丝满管后，菌落表面出现污黄色斑块，并分泌色素，使培养基呈浅黄色至茶褐色。菌龄较长的原种，在斜面边缘或底部出现胶质琥珀状的原基。
毛木耳菌丝老化后，有红褐色、珊瑚状原基出现。
银耳原种纯银耳菌丝白色，短而细密，菌丝先端生长整齐。在适宜培养基上生长，菌丝体开始呈斜立或直立状，形成蓬松的白毛团，生长速度慢，日生长量为1毫米。培养一段时间后，在白毛团上可分泌白色或黄色水珠，形成浅黄色至黄色耳芽。
香灰茵茵丝原种菌丝白色，呈羽毛状，短粗，有较强的爬壁能力，生长快，6～7天可长满斜面，3～5天分泌黑褐色色素，使培养基变黑。菌丝老化时，表面菌丝呈淡黄褐色，并出现炭质黑疤圈。
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