标签是菌种的重要标志，如果不贴标签或标签写不标准，可能造成菌种错乱，给制作者和使用者都带来麻烦，甚至造成经济损失。
一、标签规格与贴法：标签规格一般有两种：菌种袋和菌种瓶的大标签6×4厘米，试管的小标签3×2厘米。标签粘贴的位置，应在距离管口或袋口或瓶口2―5厘米处。标签要求剪裁齐整，粘贴端正。常用化学粘胶水或加防腐剂的浆糊粘贴较好。塑料袋菌种可用白色医用胶布或牛皮纸胶布作标签。
二、标签写法：科研使用或母种、原种应填写详细标签，短时期使用的生产种可写简明标签或用标签笔写上标签代号也可，减少工作量，适应生产的需要。详细标签第一横行，从左至右（1）菌种名称：可写菌种拉丁文学名的第一或第一、二个字母，第一个字母用大写，或写中文字。如L（香菇）、Ag（双孢蘑菇）、V（草菇）、Ar（蜜环菌）等。（2）初次分离时间，用阿拉伯数字写年、月、日。（3）品系或菌株，包括品系间性状的差别，不同的试验处理等内容，用阿拉伯数字编代号。（4）菌种编号，包括从不同地方引入，不同的保藏方法，不同的试验处理等内容，用阿拉伯数字编写。第二横行：（1）菌种级别：如一级、二级、三级或母种、原种、生产种。（2）分离方式：孢子分离用S表示、组织分离用T表示，菌丝移植用M表示等。（3）菌种来源：分为引种、自繁、保藏，分别写引、自、保。（4）移植次数：用F字母，字母右下用小数字，表示从分离后转接的次数。第三横行：（1）接种日期，（2）制作单位，（3）菌种评价：优、良、中、差、劣五级。生产种可填写简明标签：第一横行：（1）菌种名称，（2）分离时间，（3）品系。第二横行：（1）菌种级别，（2）分离方式，（3）移接次数，（4）制作日期。第三横行，制作单位。
