5.2 装袋方法
首先拉开菌袋一头，另一头触地，向袋内填料，装满后，将菌袋口撰住，套上塑料套环，盖上封口膜，用橡筋套住，然后翻转菌袋，从另一头继续填料，并用手压实，填满料后，再上套环，封膜，套橡筋。一般每袋装料量控制在5斤左右。另外，可采用机械装袋，根据装袋机的不同，选择合适的操作方法和配套物资。装好的菌袋，用编织袋铺地，避免磨破菌袋，整齐码放。完成装袋后，即可入甑灭菌。
6 常压灭菌
以外源常压蒸汽灭菌锅为例，首先在地面上摆放砖块，砖间间距12cm，根据供给蒸汽的锅的产生蒸汽的能力，可调整摆放砖底区域的大小（一般为1000袋/锅），砖上铺编织袋，避免毛刺扎破菌袋，然后将菌袋整齐堆码在砖底座上，用塑料膜盖住，用沙袋将塑料膜边缘密封。最后将煤车装满，并点火推入燃烧灶内，加热锅内水产生蒸汽，即开始灭菌。
灭菌过程中要注意4点：
①摆袋要平稳，下大上小，防止倒堆，并留好蒸汽通道，使蒸汽更好的加热菌袋；
②锅内水沸腾4小时后，袋内料温才可基本达到100℃，然后再维持此温度10小时后，方可停止加热，停止加热后，不急于下甑，待菌袋在甑内闷4小时后，方可出甑冷却；
③码袋要注意不易过多过紧，会直接影响灭菌效果，造成损失；
④灭菌过程中注意锅内水位，及时补充，避免锅内水烧干，亦不可经常加水，会导致灭菌温度不稳定，导致灭菌失败。
7 冷却和接种
7.1 冷却
灭好菌的菌袋，从灭菌甑取出后放置在干净、通风，并利于转运接种的区域进行冷却。冷却期间应防止二次感染，冷却区域周围不能有霉变的物质，并在冷却前提前喷施克霉灵或漂白粉水溶液对环境进行消毒处理。菌袋冷却至30℃时，即可开始接种。
7.2 接种准备
接种是生产环节中的关键，在接种前，需要对接种箱进行清理，并用消毒剂对接种箱内外进行消毒处理。然后将冷却至合适温度的菌袋放入接种箱一端，按每瓶菌种接12~15袋的比例，将合格的菌种用75%的酒精擦拭消毒后放入接种箱内，并将接种工具、酒精棉球、酒精灯、封口报纸、小封口膜(小于套环，用于防止水分散发过快)，橡筋等放入接种箱。准备好后，放入一个铁碗，内装约30ml甲醛，再放入适量高锰酸钾，并迅速关闭接种箱门，消毒30分钟后，即开开始接种操作。
7.3 接种方法
在完成接种准备后，接种人员需用消毒水对手进行消毒，然后接种箱一侧一人，进行接种。首先接种人员从手洞将手伸入接种箱，用事先准好的酒精对手进行消毒，然后用对接种钩及菌种瓶进行消毒，再用接种钩挖松菌种，再揭开菌袋封口膜，迅速将菌种钩入菌袋，并铺满整个口面，然后在菌种面上放上小塑料封口膜，再用封口报纸将口面封住，翻转菌袋，再接另一头。接好种的菌袋，轻放在接种箱内没有放菌袋的另一端。完成接种后，将菌袋取出，放入培养室进行菌丝培养。
