6.抗生素 母种培养基加入适量抗生素如链霉素、庆大霉素、金霉素等可抑制细菌的生长，加入量一般以每毫升含100～200单位为宜。银耳发现受红酵母为害时，应及时刮除有病的子实体，并喷洒每毫升100～200单位链霉素。
7.过磷酸钙 有些病原菌如白色石膏霉。褐色石膏霉等喜高温、偏碱条件，堆料时可适当增加过磷酸钙和石含量，既可提供营养又有防病作用，在菇床上局部发生这些病菌时，也可将过磷酸钙直接撒在发病的料上，能抑制病菌的蔓延。
8.波尔多液 一般用磷酸铜1公斤、生石灰1公斤和水100公斤配制而成，随配随用。蘑菇贝勒贝孢霉病的病原菌对铜制剂很敏感，用波尔多液或硫酸铜稀释液直接喷洒发病部位，对控制病害的扩大有一定作用。
9.敌百虫 草菇折翅菌蚊、平菇厉眼蕈蚊等发生严重时，可在出菇前或采菇后用90％敌百虫1000倍液喷洒。
10.敌敌畏 菇、耳房周围定期喷洒50％敌敌畏1：1000倍液、可有效消灭虫源。
11.溴氰菊酯 平菇厉眼蕈蚊发生严重时，可于采菇后用2.5％溴氰菊酯1500～2000倍液喷洒。
12.毒饵诱杀 黑腹果蝇等成虫喜在烂果或发酵物上取食和产卵，可取一些烂果和酒渣放在盘中，倒入少量50％敌敌畏1000倍液以诱杀成虫。厮腐蝇成虫对醋酒液有趋性，可用酒：糖：醋：水=1：2：3：4的糖醋酒液加上几滴敌敌畏液，置于灯光下诱杀成虫。用砷酸钙于饼糠（1：10）制成的毒饵，于傍晚撒于栽培产生附近，可诱杀蛞蝓、蜗牛。
