1.新菇棚的消毒处理棚内可使用百病去无踪、辛硫磷等药物，一般用量为1袋百病去无踪配50克辛硫磷，喷30平方米左右，用药目标为地面、墙体以及立柱等，要求地毯式喷洒，然后密封菇棚，卷起草苫晒棚，密封2天后即可进袋发菌或出菇;发菌和出菇期间的预防用药，可每5天左右喷洒一次蘑菇杀病灵或百病去无踪，但注意不要直喷子实体。
2.旧菇棚的消毒处理连续使用多年的菇棚，棚内不可避免地存有相当数量的杂菌和病原菌孢子以及害虫，因此，彻底进行消毒处理非常必要。一般可按1袋百病去无踪配40克辛硫磷药物，地毯式喷洒20平方米左右，然后密封菇棚，卷起草苫晒棚，密封2天后，再次用药并继续密闭晒棚，2～7天后，方可进袋发菌。
