DNA分子标记技术在食用菌研究中的应用及进展
Application and Prospect of DNA Molecular Markers in Edible Mushroom Researches
吴学谦 李海波 魏海龙 吴庆其 彭华正 金群英
摘 要:根据近年来国内外的文献报道,对DNA分子标记技术在食用菌遗传育种、菌种和菌株鉴定、遗传多样性分析、基因定位和克隆等研究中的应用及进展进行了综述和分析.认为随着分子生物学技术的进一步发展,将有更多、更有效的分子标记在食用菌研究中得以应用,同时随着分子标记技术应用的深入,更高密度、更为实用有效的遗传连锁图谱将被建立,大量重要的功能基因将被定位和克隆,这将为进一步培育高产、优质、抗病、耐贮等食用菌新品种奠定良好的基础.
关键词:食用菌;DNA分子标记;遗传育种;遗传多样性;基因定位及克隆
分类号:S646 文献标识码:A
文章编号:1001-3776(2004)02-0075-06
作者简介:吴学谦(1964-),男,浙江庆元人,研究员,从事食用菌育种与栽培研究.
作者单位:吴学谦(浙江省林业科学研究院生物技术研究所,浙江,杭州,310023)
李海波(浙江省林业科学研究院生物技术研究所,浙江,杭州,310023)
魏海龙(浙江省林业科学研究院生物技术研究所,浙江,杭州,310023)
吴庆其(浙江省林业科学研究院生物技术研究所,浙江,杭州,310023)
彭华正(浙江省林业科学研究院生物技术研究所,浙江,杭州,310023)
金群英(浙江省林业科学研究院生物技术研究所,浙江,杭州,310023)
参考文献:
[1]罗信昌.第15届国际食用菌科学和栽培大会简介[J].菌物系统,2000,19(4):583-584.
[2]Castle A J, Horgen P A, Anderson J B. Restriction fragment length Polymorphisms in the mushroom Agaricus brunnescens and Agaricus bitorquis[J]. Appl Environ Microbiol, 1987, 53 ( 4 ) : 816 - 822.
[3]Khush H S, Becker E, Wach M. DNA Amplification polymorphisms of the cultivated mushroom Agaricus bisporus[J]. Appl Environ. Microbiol,1992 (58) : 2971-2977.
[4]詹才新,凌霞芬,杨家林.双孢蘑菇性亲和性相关分子标记的初步筛选[J].食用菌学报,2002,9(4):1-8.
[5]代江红,林芳灿.香菇自然群体中个体间的空间分布及其遗传联系[J].菌物系统,2001,20(1):100-106.
[6]林范学,林芳灿.香菇亲本菌株及其杂交后代的RAPD分析[J].菌物系统,1999,18(3):279-283.
[7]叶明,叶生梅,马桂荣,等.香菇不同供体双单杂交育种研究[J].中国食用菌,2000,21(5):3-4.
[8]詹才新,朱兰宝,杨新美.RAPD技术在金针菇杂交育种中的应用[J].食用菌学报,1995,2(1):7-11.
[9]Zeng R, Liu Z T. Inactivated protoplast electrofusion of edible mushrooms and characterization of intergeneric fusion products [R]. In: Abstracts of 3rd International Conference of Mushroom Biology and Mushroom Products. 1999, 51
[10]肖在勤,谭伟,彭卫红,等.金针菇与凤尾菇科间原生质体融合研究[J].食用菌学报,1998,5(1):6-12.
[11]罗信昌,李英波,施庆利.分子生物学技术在菇类研究中的应用[J].食用菌学报,1995,2(4):1-10.
[12]吴康云,边银丙.黑木耳种内杂交子的鉴定技术[J].菌物系统,2002,21(2):210-214.
[13]李荣春,张丽梅.随机扩增多态DNA(RAPD)在野蘑菇杂交育种中的应用[J].微生物学通报,2001,28(5):52-55.
[14]叶明,叶生梅,潘迎捷,等.不同来源香菇双-单杂交后代的遗传研究[J].南京农业大学学报,2000,25(1):53-56.
[15]谭琦,潘迎捷,陈明杰,等.香菇申香10号菌种的选育与推广[J].食用菌学报,2000,7(3):6-10.
[16]谭琦,杨建明,陈明杰,等.用RAPD技术对香菇非对称杂交后代遗传性状的分析[J].食用菌学报,2001,8(2):10-14.
[17]罗信昌.第15届国际食用菌科学和栽培大会简介[J].菌物系统,2000,19(4):583-584.
[18]边银丙.食用菌菌种质量问题与菌种管理对策的商榷[J].中国食用菌,1999,18(4):12-14.
[19]Hibbett, D S. Phylogenetic relationships of the basidiomycete genus Lentinus: Evidence from ribosomal RNA and morphology[D]. Duke University, Durham, North Carolina, 1991, 270.
[20]Hibbett D S, R Vilgalys. Evolutionary relationships of Lentinus to the Polyporaceae: Evidence from restriction analusis of enzumatically amplified ribosomal DNA [J]. Mycologia, 1993 ( 83 ) : 425 - 439.
[21]Kulkarni R K. DNA polymorphisms in Lentinula edodes, the shiitake mushroom [J]. Appl Environ Microbiol. 1991 ( 57 ) : 1 735 - 1 739.
[22]Assigbetse K B, Femandez D, Dubcis M P, et al., Differentiation of Fusarium Oxyspomm f. sp. Vasifectum races on cotton by random amplified polymorphic DNA (RAPD)analysis[J]. Phytopathology, 1994 ( 84 ) : 622 - 626.
[23]Molnar O, Messner R, Prillinger H, et al. Genotypic identification of saccharomyces species using random amplified polified polymorphic DNA analysis [J]. System Appl Microbiol, 1995 ( 18 ) : 136 - 145.
[24]Ramirez L, Muez V, Alfonso M, et al. Use of molecular markers to differentiate between commercial strains of the button mushoom Agaricus bisporus[J]. FEMS Microbiol Lett, 2001 . 198 ( 1 ) : 45 - 48.
[25]曾东方,罗信昌.应用RAPD分析快速鉴定外生菌根蘑菇分离物的真伪[J].林业科学,2001,37(6):59-65.
[26]李英波,罗信昌,李滨,等,香菇菌株限制性片段长度多态性[J].中国食用菌.1995,14(2):10-16.
[27]张引芳,潘迎捷,陈春涛,等.中国香菇栽培品种的遗传相关性研究[J].农业生物技术学报.1996.4(2):141-146.
[28]王镭,谭琦,陈明杰,等.从DNA水平上分析香菇不同菌株的遗传差异[J].食用菌学报,1997,4(4):2 J-24
[29]詹才新,朱兰宝,杨新美.利用RAPD技术评估金针菇种质资源[J].食用菌学报,1997,4(1):1-7.
[30]詹才新,张引芳,凌霞芬,等.中国主栽双孢蘑菇菌株的DNA多态性[J].食用菌学报,1998,5(2):1-7.
[31]施庆利,罗信昌.RAPD技术在木耳杂交种及原生质体融合子鉴定分析中的应用[J].中国食用菌.1994,12(6):3-4.
[32]罗信昌,曾东方.外生菌根蘑菇分离菌株的DNA鉴定方法[J].微生物学杂志,2001,21(2):26-29.
[33]阎培生,罗信昌,周启.利用RAPD技术对木耳属菌株进行分类鉴定的研究[J].菌物系统,2000,19(1):29-33.
[34]沈天峰,王朝江,罗信昌,等.木耳属四个野生菌株的RAPD图谱分析[J].食用菌学报,2001,8(4):1-4
[35]黄志龙,谢宝贵,谢福泉,等.15个代料栽培香菇菌株的分子鉴别[J].食用菌学报,2002,9(3):5-8.
[36]陈明杰,赵绍惠,张树庭.用分子生物学技术对草菇进行菌株鉴别[J].真菌学报,1996,15(2):129-134.
[37]陈明杰,凌霞芬,王南,等.草菇组织分离物的遗传变异研究(Ⅱ)[J].食用菌学报,2000,7(2):1-4.
[38]Molina FI, Shen P, Jong S H, et al. Molecular evidence supports the separation of Lentinula edodes from Lentinus and related genera[J].Can J Bot, 1992 ( 70 ) : 2 446 - 2 452.
[39]Nicholson M S, Bunyard B A, Royse D J. Phylogeny of the genus Lentinula based on ribosomal DNA restriction fragment length polymorphism analysis [J]. Mycologia, 1997, 89 ( 3 ) : 400 - 407.
[40]曾伟.宋思扬,王泽生,等.双孢蘑菇及大肥菇的种内及种间多态性RAPD分析[J].菌物系统,1999(18):55-60.
[41]李荣春.双孢蘑菇遗传多样性分析[J].云南植物研究,2001,23(4):444-450.
[42]Sagawa I, Tanaka M, Nagata Y. Discrimination of mushrooms in genus Pleurotus by DNA restriction fragment length polymorphism [J].J Gen Appl Microbiol, 1992 ( 38 ) : 597 - 603.
[43]马富英,罗信昌.28SrDNA PCR-RFLP分析在侧耳属系统发育研究中的应用[J].华中农业大学学报,2002,21(3):201-205.
[44]鲍大鹏,王南,陈明杰,等.采用ARDRA和RAPD对柳松菇菌株遗传多样性的分析[J].上海农业学报,2001,17(1):18-22.
[45]Bunyard B A, Nicholson M S, Royse D J.A. Systematic assessment of Morchella using RFLP analysis of the 28S ribosomal RNA gene [J].Mycologia, 1994, 86 ( 6 ) : 762 - 772.
[46]曾东方,罗信昌,陈升明.珍稀共生食用真菌松茸DNA指纹研究[J].园艺学报,2000,27(3):223-225.
[47]Moncalvo J M, Wang H H, Hseu R S. Phylogenetic relationship in Ganoderma inferred from the internal transcribed spacers and 25S ribosomal DNA sequences[J]. Mycologia, 1987, 79 ( 2 ) : 223 - 238.
[48]Anderson J B, Petsche D M, Smith M L, et al. Restriction fragment length polymorphisms in biological species of Armillaria mellea [J].Mycologia, 1987 ( 79 ) : 69 - 76.
[49]秦国夫,贺伟,沈瑞祥.中国蜜环菌生物种的RAPD分析.真菌学报,1996,15(1):26-33.
[50]Lanfranco L, Myss P, Marzachi G, et al. DNA Probes for identification of the ectomycorrhizal fungus Tuber magnatum Pico [J]. FEMS Microbiol Lett, 1993 ( 114 ) : 245 - 252.
[51]Gandeboeuf D, Dupre C, Nicolas P, et al. Grouping and identification of Tuber Species using RAPD markers [J]. Can J Bot, 1997 ( 75 ): 36 - 45.
[52]阎培生,罗信昌,周启.木耳属真菌rDNA特异性扩增片段的RFLP研究[J].菌物系统,1999,18(2):206-213.
[53]陈作红,张志光,张天晓.鹅膏菌属真菌RAPD分析及亲缘关系的研究[J].菌物系统,2000,19(1):51-55.
[54]Kerrigan R W, Royer J C, Baller L M, et al., Meiotic behavior and linkage relationships in the secondarily homothallic fungus Agaricus bisporus[J]. Genetics, 1993 ( 133 ) : 225 - 236.
[55]Larraya L M, Perez G, Ritter E, et al., Genetic linkage map of the edible basidiomycete Pleurotus ostreatus [J]. Appl Environ Microbiol, 2000,66(12) : 5290-5300.
[56]Xu J, Kerrigan R W, Horgen P A. et al., Localization of the mating type gene in Agaricus bisporus[J]. Appl Environ Microbiol, 1993 ( 59 ) :3 044 - 3 049.
[57]Lofius M G, Lodder S C, Legg E J. Molecular mushroom breading. In: Elliott TJ (ed.), Science and Cultivation of Edible Fungi. The Netherlands: Balkema, Rotterdam. 1995, 3 - 9.
[58]Sonnerberg A S, de Groot P W, Schaap P J, et al. Isolation of expressed sequence tags of Agaricus bisporus and their assignment to chromosomes [J]. Appl Environ Microbiol, 1996, 62 ( 12 ) : 4 542 - 4 547.
[59]宋思扬,曾伟,陈融,等.一个与双孢蘑菇子实体品质相关的DNA片段的克隆[J].食用菌学报,2000,7(3):11-15.
[60]陈兰芬,宋思扬,郑忠辉,等.RT-RAPD技术分析高温诱导双孢蘑菇相关基因片段[J].厦门大学学报(自然科学版),2002,41(1):103-107.
[61]潘迎捷.国际食用菌研究进展[J].吉林农业大学学报:1998,20(增刊):64-66.
[62]陈明杰,谭琦,严培兰,等.草菇低温诱导基因的分离[J].菌物系统,1998,17(4):327-330.
[63]Muraguchi H, Kamada T. The ichl gene of the mushroom Coprinus cinereus is essential for pileus formation in fruiting [J]. Development, 1998,125 (16) : 3133-3141.
浙江林业科技
JOURNAL OF ZHEJIANG FORESTRY SCIENCE AND TECHNOLOGY
2004 Vol.24 No.2 P.75-80