随着农村生产力的发展，农民专业合作社作为一种新兴的市场经营主体应运而生。对于培育和打造区域经济的主导产业来说，农民专业合作社发挥了重要作用。
以许昌县百珍食用菌合作社为例，它以河南世纪香食用菌开发有限公司为依托，采取“合作社+农户+基地”的运行机制，发展社员263人，辐射带动了许昌县及周边30多个食用菌生产专业村的5万多户种植户，建成了13个年产千吨的无公害食用菌标准化生产基地，并形成了辐射全国26个省市、683家专业合作社及3.9万户种植户的服务网络。2008年1月，国务院副总理回良玉到该合作社的无公害食用菌标准化生产基地视察，高度赞扬合作社的运行机制，指出合作社实现了一产、二产、三产的有机结合。
这样的例子还有很多。襄城县恒源种植专业合作社积极带领广大社员种植白灵菇、鸡腿菇等食用菌，建立了襄城县第一个食用菌研究中心，目前发展社员445人，带动农户3132户。禹州市兴达畜牧饲养专业合作社联结社员积极开展无公害生猪饲养，已拥有48家标准化饲养场，年出栏生猪5万余头，成为禹州市重要的饲养基地之一。
