香菇重组交换在基因组中的分布特征
易菇网讯 12月15日，华中农业大学植物科学技术学院边银丙教授领衔的应用真菌研究团队联合中国农业科学院麻类研究所在Journal of fungi（2020IF=5.816）上在线发表了题为“Chromosome-wide characterization of intragenic crossover in shiitake mushroom, Lentinula edodes”的研究论文，龚文兵副研究员为论文第一作者，肖扬副教授为通讯作者。该研究首次表征了香菇重组交换特征及其热点分布，并对香菇重组交换变异进行了遗传解析。
重组交换（crossovers，COs）是减数分裂的核心事件，亦是基因组进化和遗传多样性形成的关键驱动力之一，是育种的基础。通过遗传作图研究重组交换，分析COs在基因组中的分布，了解重组热点形成机制，挖掘调控重组变异的遗传位点，有助于开发有效方法调控重组发生，打破育种的瓶颈。本研究利用香菇 F1 单核体群体的基因型数据，在全基因组水平对香菇的重组交换进行了表征，鉴定了884个COs，主要聚集于65个COs热点区域，并分析了热点区域的富集基序。随后利用连锁分析鉴定了调控不同类型重组交换变异的遗传位点及候选基因，该结果有利于加深对大型真菌同源重组保守型与多样性机制的认识水平。
该成果是团队在香菇遗传学研究领域取得的又一重要进展。今年3月和9月，团队先后在Journal of Advanced Research (2020IF=10.479) ，Computational and Structural Biotechnology Journal (2020IF=7.271) 发表重要研究论文。相关研究获得了国家自然科学基金、国家重点研发计划和华中农业大学自主科技创新基金等项目的资助。
文章链接：https://www.mdpi.com/2309-608X/7/12/1076
