【作者】肖长坤 郑建秋 李健强 师迎春 Hasan Bolkan
【机构】北京市植物保护站 中国农业大学农学与生物技术学院植物病理系中国农业大学农学与生物技术学院植物病理系 北京100029北京100019 北京100019Campbell Researchand Development Campbell Soup CompanyDavisCA95616USA.
【摘要】本文以来自国内外的20株白菜黑斑病菌及近源种为研究材料,进行了5.8SrDNA及其侧翼ITS区的克隆、测序、序列变异及遗传进化关系分析。黑斑病菌及其近源种真菌核糖体5.8SrDNA及其侧翼ITS区序列比对结果显示,不同种菌株ITS1比ITS2在碱基构成上有更大变异,而且ITS1的序列长度变异比ITS2的大;而种内虽然各菌株的寄主和地理来源不同,但ITS1和ITS2在长度上均没有变异,碱基构成上存在微小的变异。对该区序列的聚类分析表明,白菜黑斑病菌3个种芸薹链格孢Alternariabrassicae、甘蓝链格孢A.brassicicola和萝卜链格孢A.japonica虽然地理来源和寄主不同,但种内的不同菌株均在一个独立的聚类组中,种之间以及其和链格孢属内其它种在聚类关系上能明显分开,可基于该区进行黑斑病菌的分类鉴定。
【基金】国家“十五”科技攻关计划专题项目(编号2002BA516A08-11)部分内容；
【关键词】聚类分析; 分类鉴定; A.brassicae; A.brassicicola; A.japonica;
黑斑病菌及其近源种 5.8S rDNA 侧翼 ITS1 聚类分析树状图
黑斑病菌及其近源种 5.8S rDNA 侧翼 ITS2 聚类分析树状图