橙黄乳菇遗传多样性分析
Genetic Diversity of Lactarius akahatsu from China and Thailand
【作者】 李河； 徐建平； 郭亮； 刘君昂； 周国英； 朱丹雪；
【Author】 LI He1,2,XU Jianping1,2,GUO liang2,LIU Jun’ang1,2,ZHOU Guoying1,2,ZHU Danxue2 1Key Laboratory for Non-wood Forest Cultivation and Conservation of the Ministry of Education; Central South University of Forestry and Technology;Changsha,Hunan 410004,China; 2College of Forestry,Central South University of Forestry and Technology,Changsha,Hunan 410004;China
【机构】 经济林培育与保护教育部重点实验室,中南林业科技大学； 中南林业科技大学林学院；
【摘要】 分析来自湖南省道县(DX)、张家界市(ZJJ)、芷江县(ZJ)、麻阳县(MY)和贵州省玉屏县(YP)以及泰国(TL)6个橙黄乳菇种群38个菌株的ITS-5.8S序列的遗传结构和遗传多样性。所有的ITS-5.8SrDNA序列样品共检测到2个变异位点,碱基A、T、G、C的平均含量分别为22.5%、26.9%、22.7%和27.9%。根据序列的核苷酸变异共定义了3种单倍型,其中单倍型Hapolotype 3是湖南和贵州5个种群共享单倍型,Hapolotype 2为6个种群的共享单倍型。中国橙黄乳菇各地区种群的单倍型多样性(haplotype diversity,HD)在0.21875～0.59375之间,表明橙黄乳菇种群具有较高的单倍型多样性。遗传分化指数(fixation index,FST)表明,不同地理种群间的遗传分化较大。AMOVA分析显示,种群间的遗传变异占总变异的17%,种群内部变异占总变异的83%。Mantel测试显示地理距离与种群的遗传分化FST值之间线性关系显著(P<0.05)。采用N-J法构建的分子系统树表明,当与乳菇属相近种进行比较时,湖南、贵州和泰国不同地区的所...
【关键词】 橙黄乳菇； 地理种群； 遗传多样性； 遗传分化； ITS-5.8S序列；
【文内图片】
植黄乳菇种群间的遗传分化FST
值橙黄乳菇群体的Mismatch分布
基于ITSs,ss序列的r{系统树
【基金】 国家自然科学基金(编号:30972371)的部分研究内容
【分类号】S646