【作者】 刘芳； 王威； 谢宝贵；
【Author】 LIU Fang;WANG Wei;XIE Baogui;Mycological Research Center of Fujian Agriculture and Forestry University;
【机构】 福建农林大学菌物研究中心；
【摘要】 以金针菇(Flammulina velutipes)1123菌株的单孢W23基因组为参考完成其菌丝和原基转录组测序与数据分析,研究两样本间差异基因,并对差异基因进行GO功能和KEGG Pathway显著性富集分析。结果表明:两个样本中共有显著性差异表达的基因3310个,其中在原基中上调、下调的基因数分别为1686、1624个,只在原基中表达的基因有26个。GO功能分析结果表明,在原基中膜封闭腔、内膜系统、细胞器腔、核糖核蛋白复合体、翻译调节器、发育过程、免疫系统过程、多细胞生物过程这8个GO基本单元中的差异基因全部呈现上调表达。Pathway功能富集分析结果表明,核糖体与DNA复制中的差异基因全部呈现上调表达,糖酵解途径中从D-葡萄糖转化成丙酮酸过程相关的11个差异基因全部呈下调表达,磷酸戊糖途径中相关的13个差异基因中有11个基因呈下调表达。 更多还原
【关键词】 原基； 差异基因表达； GO功能； Pathway分析；
【文内图片】
【基金】 国家现代农业产业技术体系建设专项资金(编号:CARS24);973计划项目(编号:2014CB138302)基金资助