【作者】 汪虹； 陈明杰； 鲍大鹏；
【Author】 WANG Hong,CHEN Mingjie,BAO Dapeng National Engineering Research Center of Edible Fungi;Shanghai Key Laboratory of Agricultural Geneticsand Breeding;Institute of Edible Fungi,Shanghai Academy of Agricultural Sciences,Shanghai 201403,China
【机构】 农业部南方食用菌资源利用重点实验室国家食用菌工程技术研究中心上海市农业遗传育种重点开放实验室上海市农业科学院食用菌研究所；
【摘要】 根据担子菌丝/苏氨酸蛋白激酶同源基因编码的氨基酸序列设计两对简并引物,通过巢式简并PCR方法获得草菇(Volvariella volvacea)丝/苏氨酸蛋白激酶同源基因(vv-stpk1)的保守片段,然后通过基因组步行的方法获得了vv-stpk1全长序列。vv-stpk1全长为2 003 bp,含有8个内含子,长度分别为72、57、53、54、45、50、55和48 bp,可编码522个氨基酸残基的多肽。推定的氨基酸序列与玉米黑粉菌(Ustilagomaydis)、木糖发酵酵母(Pichia stipitis)、新型隐球菌(Cryptococcus neoformans)中与细胞形态发生相关的丝/苏氨酸蛋白激酶Orb6的相似性分别为81%、77%和76%,对VV-STPK1蛋白的系统发生学分析的结果表明,VV-STPK1与Orb6同源蛋白聚在同一进化枝上,这些数据都支持VV-STPK1蛋白为与细胞形态发生相关同源蛋白的推定。
【Abstract】 Two pairs of degenerate primers,designed according to the conserved amino acid sequences of several basidiomycete ser/thr protein kinases,were used in nested PCR to amplify the corresponding conserved DNA sequence from Volvariella volvacea.The complete DNA sequence of the ser/thr protein kinase(vv-stpk1) was then obtained by genome walking.vv-stpk1 was 2 003 bp in size,encoding for 522 amino acids,and contained eight introns.VV-STPK1 exhibited 81%,77% and 76% similarity with Orb6,a ser/thr prote...
【关键词】 草菇； 丝/苏氨酸蛋白激酶； 克隆； 序列分析；
【Key words】 Volvariella volvacea； ser/thr protein kinase； gene clone； sequence analysis；
【基金】 上海市农业科学院院发基金[编号:上海农科院农科发2008(16)];上海市科委科技攻关重点项目(编号:10DZ2212400)的部分研究内容
【分类号】S646.13